Po postavitvi suma na celiakijo, se izvedejo preiskave. Osnova so krvne preiskave, oz. določanje prisotnosti za celiakijo značilnih protiteles. Če so le-ta prisotna, vedno opravimo tudi biopsijo sluznice tankega črevesa. V nekaterih primerih nam v diagnostiki pomagajo tudi genetske preiskave, ki jih na Kliniki za pediatrijo UKC Maribor opravimo vsem bolnikom pa tudi njihovim sorodnikom. Ne glede na to, biopsija sluznice tankega črevesa in dokaz značilnih sprememb pod mikroskopom ostaja zlati standard pri postavljanju diagnoze.V prihodnje veliko obetamo od novih metod, ki bodo iz kapljice krvi omogočile hkratno določanje genetskega zapisa in koncentracijo protiteles značilnih za celiakijo. Velik multicentrični projekt CD- MEDICS, v katerem sodeluje tudi naš center za celiakijo, imamo za cilj razviti prav takšno diagnostično orodje. S tem se bo obremenitev za bolnike zmanjšala, prav tako pa bo pot do postavitve prave diagnoze krajša.